Sem nenhum número oficial de mortos actualizado e com organizações estrangeiras de direitos humanos enfrentando bloqueios crónicos de comunicação, o número de mortes no Irão permanece em grande parte desconhecido.
A última vez que o Ministério da Saúde do Irão forneceu uma estimativa do número de mortos foi em 8 de Março, o nono dia do conflito. Ele então anunciou que cerca de 1.200 civis foram mortos em ataques aéreos dos EUA e de Israel em todo o país.
A ONG Human Rights Activists News Agency (HRANA), sediada nos Estados Unidos, que desempenhou um papel importante no registo das mortes durante as manifestações antigovernamentais de Janeiro, esmagadas em sangue, estima o número de civis mortos no conflito em 1.407 pessoas, incluindo 214 crianças.
O Crescente Vermelho Iraniano não fornece estimativas de vítimas, mas os seus números mais recentes indicam que 61.555 casas, 19.000 empresas, 275 centros médicos e quase 500 escolas foram danificadas. Embora o Irão tenha reconhecido cerca de 3.000 mortes, principalmente entre as forças de segurança, investigadores e activistas estrangeiros estimam que entre 7.000 e 35.000 pessoas foram mortas nessa altura.
A maior perda de vidas civis na guerra até à data foi o agora infame ataque aéreo a uma escola primária em Minab, onde pelo menos 165 pessoas foram mortas, de acordo com um balanço oficial.
L’ObservaThor